藥物的不良反應是很多患者所關注的，艾沙康唑應慎用于已知對其他唑類抗真菌藥有超敏反應的患者。艾沙康唑的超敏反應可能導致的不良反應包括低血壓、呼吸衰竭、呼吸困難、藥疹、瘙癢和皮疹。在使用硫酸艾沙康唑膠囊時，還應注意藥物之間的相互作用。